将来、大学院進学をする学生は早めに計画を立てて、アドバイザーや卒研指導教員に相談し準備するようにしてください。入学試験はセメスター制度に適合しており、春学期入学（4月）と秋学期入学（10月）を選んで受験することができます。
静岡キャンパスには、海洋学研究科（修士課程2年）が設置されています。修士課程は、広い視野にたって精深な学識を授け、専攻分野における研究能力または高度の専門性を要する職業などに必要な能力を養うことを目的としています。また、修士課程修了後には大学院（博士課程）へ進む道もあります。